Если продавец в магазине спрашивает у вас «come again?», не следует понимать это как вопрос «опять пришли?». Скорее всего он просто не расслышал сказанное вами и хочет уточнить (что-то вроде русского «как-как?» ;).
(— Берешь ли ты, Платон Вагин, в жены Алису Тролле? — Чего-чего?)